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作为合肥综合性国家科学中心七大创新平台之一合肥离子医学中心项目，依托国家大科学工程，以“自主+合作”的创新模式，设立质子治疗和自主研制两个项目主体，建设集离子医学技术研发、治疗、培训、数据化处理中心以及高端医疗装备研发、关键部件制造、系统集成和产业化两个公共平台为一体的创新科技基地。 2019年底，由合肥离子医学中心有限公司投资建设的合肥离子医学中心项目竣工验收会议顺利召开，标志着合肥离子医学中心基建项目全部完成。2020年6月11日，中心迎来首例住院治疗患者，这标志着离子医学中心非质子治疗系统部分已正式进入试运营阶段。项目正式投入使用后，每年可以帮助数千癌症患者摆脱病痛，助力我国核医疗事业发展和创新型国家建设。
集团与中科院合肥物质科学研究院、蜀山区政府依托“大气环境污染监测先进技术与装备国家工程实验室”，以“新技术、新装备”产业化需求发展为导向，通过机制创新与技术创新，三方共建中科环境监测技术国家工程实验室有限公司，专注于为“环境、气象、海洋、交通”行业用户提供先进的技术应用服务和智慧解决方案。 集团将充分发挥国有资本平台作用，助力中科环境公司做强做大环境监测领域，立足空气质量监测，向水质、土壤、固废物污染监测领域全面迈进，立足合肥，扎根安徽，辐射长三角，布局全国，构建现代城市环境治理体系，全面推动绿色发展，打造服务于长三角地区的环境产业高地，建设“中国环境谷”。
集团与中国科学院合肥物质科学研究院于2014年共同投资组建，通过重大科技创新带动规模产业化，统筹推进“创新链-产业链-人才链-资本链-服务链”五链共建，打造“产业技术、创新人才创业投资、双创服务”四位一体的创新创业生态体系，设计并构建起“引导性股权投资+政府基金+社会资本+产业化专项基金+风险投资”的多元投资融资体系，成立国内首支科技成果转移转化定向投资基金。 截至2020年3月，累计投资孵化企业80家，为企业引入外部投资8.4亿元；21家企业通过“国家高新技术企业”认定；3家企业入选合肥高新区瞪羚及瞪羚培育企业；建设工程技术研发中心15个；多渠道引培双创团队百余个，其中荣获国家各类双创人才称号39人。
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